内分泌失调：女性体内的激素水平对胚胎的发育至关重要。如果孕期雌激素、孕激素、绒毛膜促性腺激素等分泌不足，无法满足胚胎生长的需求，就可能导致胎停。例如，甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能亢进还是减退，都会影响胎儿的神经系统发育，增加胎停的风险。还有多囊卵巢综合征患者，其体内激素失衡，也容易在孕早期出现胎停的情况。
免疫系统异常：正常情况下，母体的免疫系统能够识别并保护胎儿，不会对胚胎发起攻击。但当免疫系统出现异常时，就可能将胚胎误认为 “外来异物”，发动免疫攻击，导致胚胎停止发育。常见的自身免疫性疾病，如抗磷脂综合征、系统性红斑狼疮等，都会使孕妇体内产生一些自身抗体，影响胎盘的血液循环和胚胎的营养供应，进而引发胎停。
子宫环境不佳：子宫是胚胎生长的 “温床”，如果这个 “温床” 出现问题，胚胎也难以存活。像子宫畸形（如纵隔子宫、双角子宫）、子宫内膜过薄或过厚、子宫肌瘤、子宫内膜息肉等，都会影响胚胎的着床和发育。例如，子宫内膜过薄，胚胎无法获得足够的营养；子宫肌瘤如果生长在子宫腔内，会占据胚胎生长的空间，这些都可能导致胎停。
不良生活习惯：孕妇在孕早期吸烟、酗酒、过度熬夜等不良生活习惯，都可能对胚胎发育造成不良影响。香烟中的尼古丁、焦油等有害物质，以及酒精，会通过胎盘进入胎儿体内，干扰胎儿的正常发育，增加胎停的几率。而长期熬夜会导致孕妇内分泌失调，影响身体的新陈代谢，同样不利于胚胎的生长。
化学物质与辐射：孕期接触过多的化学物质，如甲醛、苯、农药等，以及长期暴露在高强度的辐射环境下，如 X 射线、CT 检查、微波炉、电脑等产生的辐射，都可能对胚胎的 DNA 造成损伤，导致染色体异常，从而引发胎停。尤其是新装修的房屋，甲醛等有害气体含量较高，孕妇长期居住在这样的环境中，胎停的风险会显著增加。
病毒感染：在孕早期，孕妇的免疫力相对较低，容易受到病毒的侵袭。如风疹病毒、巨细胞病毒、弓形虫、单纯疱疹病毒等感染，这些病毒一旦感染孕妇，就可能通过胎盘传播给胎儿，引起胎儿发育异常，导致胎停。例如，孕妇在孕早期感染风疹病毒，胎儿出现先天性心脏病、白内障、耳聋等畸形以及胎停的风险会大大增加。